| 順位 | 組-順 | 氏名 | 所属 | 記録 | 事由 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 3-1 | 辰本 可成(2) 大分 | 臼杵東中 | 2'07"34 | |
| 2 | 3-2 | 松田 智寛(1) 大分 | 大分中央陸上 | 2'08"00 | |
| 3 | 2-1 | 八木 拓実(2) 大分 | 鶴谷中 | 2'11"23 | |
| 4 | 3-3 | 安達 澄陽(1) 大分 | 昭和中 | 2'17"24 | |
| 5 | 3-4 | 二村 篤樹(2) 大分 | 臼杵東中 | 2'17"26 | |
| 6 | 3-5 | 松下 礼恩(1) 大分 | 臼杵東中 | 2'19"88 | |
| 7 | 2-2 | 御手洗創太(1) 大分 | 鶴谷中 | 2'22"24 | |
| 8 | 1-1 | 袖 瑞希(1) 大分 | 蒲江翔南中 | 2'27"87 | |
| 9 | 1-2 | 野見山純正(2) 大分 | 津久見第一中 | 2'30"37 | |
| 10 | 2-3 | 三嶋 奏汰(1) 宮崎 | 延岡土々呂中 | 2'33"61 | |
| 11 | 2-4 | 川野 琥(2) 大分 | 津久見第二中 | 2'34"95 | |
| 12 | 1-3 | 太田 柳也(1) 大分 | 鶴谷中 | 2'38"98 | |
| 13 | 1-4 | 甲斐 一真(1) 大分 | 鶴谷中 | 2'39"23 | |
| 14 | 1-5 | 戸篠 大雅(1) 大分 | 佐伯南中 | 2'40"46 | |
| 15 | 2-5 | 稲垣 尚志(1) 宮崎 | 延岡土々呂中 | 2'43"30 | |
| 16 | 1-6 | 戸高 悠翔(1) 大分 | 彦陽中 | 2'43"49 | |
| 17 | 2-6 | 森 悠人(1) 宮崎 | 延岡土々呂中 | 2'43"86 | |
| 18 | 1-7 | 飛河 絆(1) 大分 | 佐伯南中 | 2'56"24 | |
| 19 | 2-7 | 中津留佳浬(2) 大分 | 津久見第二中 | 3'06"32 | |
| 3- | 小泉 遥暉(2) 宮崎 | 延岡土々呂中 | 欠場 | ||
| 2- | 寺本 大翔(2) 大分 | 蒲江翔南中 | 欠場 |